added template for c apps

README.md

@@ -13,6 +13,8 @@ clúster computacional de CIBioFi.
         - [Lectura de archivos desde NFS](docker/R/read)
         - [Escritura de archivos desde NFS](docker/R/write)
         - [Instalación de requerimientos para R](docker/R/requirements)
+  - Aplicativos
+        - [Aplicativos en C](docker/aplicativos_en_c) 
 - [Cuda](gpu)
 
 Para solicitar una plantilla específica de un lenguaje de programación,

docker/aplicativos_en_c/Dockerfile

@@ -0,0 +1,31 @@
+# Primero seleccione una versión de sistema operativo base, en este caso Ubuntu en su versión 18.04
+
+FROM ubuntu:18.04
+
+# Instale los requerimientos de sistema operativo necesarios
+RUN apt-get update
+RUN apt-get install -y g++ build-essential wget zlib1g-dev
+
+# Defina un directorio de trabajo
+
+RUN mkdir /code
+WORKDIR /code
+
+# Inicie la descarga del programa
+RUN wget http://catchenlab.life.illinois.edu/stacks/source/stacks-2.4.tar.gz
+RUN tar xfvz stacks-2.4.tar.gz
+
+# Cambie su dirección de trabajo para realizar la instalación
+WORKDIR /code/stacks-2.4
+RUN ./configure
+RUN make
+RUN make install
+
+# Defina un volumen para compartir información desde su anfitrión hacia su contenedor
+RUN mkdir /datos
+
+VOLUME /datos
+
+# Defina un punto de entrada para la aplicación
+CMD ["bash"]
+

docker/aplicativos_en_c/README.md

@@ -0,0 +1,51 @@
+# Aplicativos en C
+
+Con frecuencia, no se codifica una herramienta desde cero sino que se una herramienta de código abierto existente.
+
+En este ejemplo se muestra la configuración de una imagen Docker para usar una aplicación existente escrita en C.
+
+```Dockerfile
+# Primero seleccione una versión de sistema operativo base, en este caso Ubuntu en su versión 18.04
+
+FROM ubuntu:18.04
+
+# Instale los requerimientos de sistema operativo necesarios
+RUN apt-get update
+RUN apt-get install -y g++ build-essential wget zlib1g-dev
+
+# Defina un directorio de trabajo
+
+RUN mkdir /code
+WORKDIR /code
+
+# Inicie la descarga del programa
+RUN wget http://catchenlab.life.illinois.edu/stacks/source/stacks-2.4.tar.gz
+RUN tar xfvz stacks-2.4.tar.gz
+
+# Cambie su dirección de trabajo para realizar la instalación
+WORKDIR /code/stacks-2.4
+RUN ./configure
+RUN make
+RUN make install
+
+# Defina un volumen para compartir información desde su anfitrión hacia su contenedor
+RUN mkdir /datos
+
+VOLUME /datos
+
+# Defina un punto de entrada para la aplicación
+CMD ["bash"]
+```
+
+Para la construcción de este archivo ejecute un comando `compile_docker_image.sh`
+
+```bash
+bash compile_docker_image.sh
+```
+
+Y por último envíe la tarea usando
+
+```bash
+condor_submit condor.submit
+```
+