plantillas-cluster/docker/R/requirements

Instalación de requerimientos para R

En esta plantilla encontrará:

• compile_docker_image.sh: Un script que construye y despliega la imagen automáticamente al registro de CIBioFi
• condor.submit: El archivo para enviar la tarea a HTCondor
• Dockerfile: Archivo de construcción de imagen Docker personalizada
• requirements.R: Script con código fuente
• install.R: Archivo de requerimientos de R

Instruciones de uso

Por favor modifique el archivo install.R indicando las librerías necesarias para su script

if(!require(plumber))install.packages("plumber")

Modifique luego el archivo requirements.R y coloque aquí su script.

Por último ingrese al nodo master.cibiofi.univalle.edu.co (192.168.27.25) mediante SSH y copie en su sistema de archivos la plantilla modificada (use SCP o Filezilla)

Ejecute el script compile_docker_image.sh

bash compile_docker_image.sh

Y por último envíe la tarea usando

condor_submit condor.submit