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bb466ea28c
3 changed files with 6 additions and 5 deletions
  1. 3
    2
      Dockerfile
  2. 1
    1
      README.md
  3. 2
    2
      condor.submit

+ 3
- 2
Dockerfile View File

1
 FROM r-base
1
 FROM r-base
2
 
2
 
3
-RUN apt install -y libgdal-dev libproj-dev
3
+RUN apt-get update
4
+RUN apt-get install -y libgdal-dev libproj-dev
4
 
5
 
5
 WORKDIR /code
6
 WORKDIR /code
6
 ADD install.R /code
7
 ADD install.R /code
7
 RUN Rscript install.R
8
 RUN Rscript install.R
8
 
9
 
9
-CMD ["Rscript"]
10
+CMD ["Rscript"]

+ 1
- 1
README.md View File

22
 
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 Para compilar la imagen de docker en el cluster se usa el archivo [compile_docker_image.sh](compile_docker_image.sh), exactamente como en la plantilla.
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 Para compilar la imagen de docker en el cluster se usa el archivo [compile_docker_image.sh](compile_docker_image.sh), exactamente como en la plantilla.
24
 
24
 
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-Se modifica también el archivo [condor.submit](condor.submit) para definir cuales son los archivos que se deben transferir al contenedor, cuales son los argumentos que se le pasan al ejecutable `/usr/bin/Rscript` que en este caso será el nombre del script y la ruta de los datos .
25
+Se modifica también el archivo [condor.submit](condor.submit) para definir la imagen de docker, cuales son los archivos que se deben transferir al contenedor, cuales son los argumentos que se le pasan al ejecutable `/usr/bin/Rscript` que en este caso será el nombre del script y la ruta de los datos .

+ 2
- 2
condor.submit View File

2
 when_to_transfer_output = ON_EXIT_OR_EVICT
2
 when_to_transfer_output = ON_EXIT_OR_EVICT
3
 transfer_input_files = 00-CalculosIndicesVegetacion.R
3
 transfer_input_files = 00-CalculosIndicesVegetacion.R
4
 Universe = docker
4
 Universe = docker
5
-docker_image = 192.168.27.25:5000/ma0/plumber_test
5
+docker_image = 192.168.27.25:5000/ma0/calculo_indices_vegetacion
6
 Executable = /usr/bin/Rscript
6
 Executable = /usr/bin/Rscript
7
 Arguments = 00-CalculosIndicesVegetacion.R /datos/ma0/calculo_bandas
7
 Arguments = 00-CalculosIndicesVegetacion.R /datos/ma0/calculo_bandas
8
 Log = vegetacion_log.log
8
 Log = vegetacion_log.log
9
 Output = vegetacion_out.out
9
 Output = vegetacion_out.out
10
 Error = vegetacion_err.err
10
 Error = vegetacion_err.err
11
-Queue
11
+Queue

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