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Mauricio Collazos
f1b250675c
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hace 5 años | |
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| Dockerfile | hace 5 años | |
| README.md | hace 5 años | |
| compile_docker_image.sh | hace 5 años | |
| condor.submit | hace 5 años | |
| install.R | hace 5 años | |
| requirements.R | hace 5 años | |
README.md
README.md
Instalación de requerimientos para R
En esta plantilla encontrará:
- compile_docker_image.sh: Un script que construye y despliega la imagen automáticamente al registro de CIBioFi
- condor.submit: El archivo para enviar la tarea a HTCondor
- Dockerfile: Archivo de construcción de imagen Docker personalizada
- requirements.R: Script con código fuente
- install.R: Archivo de requerimientos de R
Instruciones de uso
Por favor modifique el archivo install.R indicando las librerías necesarias para su script
if(!require(plumber))install.packages("plumber")
Modifique luego el archivo requirements.R y coloque aquí su script.
Por último ingrese al nodo master.cibiofi.univalle.edu.co (192.168.27.25) mediante SSH y copie en su sistema de archivos la plantilla modificada (use SCP o Filezilla)
Ejecute el script compile_docker_image.sh
bash compile_docker_image.sh
Y por último envíe la tarea usando
condor_submit condor.submit